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Suite à sa reconnaissance en tant que Réserve Naturelle nationale, le Pinail fait l’objet d’une attention particulière. Sa gestion a été confiée à l’association GEREPI (GEstion de la REserve naturel nationale du Pinail). Depuis 1995, le site fait l’objet d’un plan de gestion (document fixant des objectifs de gestion et les opérations à mener) renouvelé tous les 5 ans. Ce troisième plan, couvrant la période 2004-2008, est composé de quatre sections, la première étant consacrée à l’approche descriptive et analytique de la réserve (localisation, statut, historique, environnement et patrimoine). La seconde tente d’évaluer la valeur patrimoniale des espèces et milieux présents sur le site afin de fixer des objectifs de gestion sur le long terme. La section 3 définit les opérations à mener pour répondre aux objectifs fixés. Enfin une dernière partie analyse le plan de gestion précédent.