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Etendues d’eaux naturelles ou artificielles, les zones humides littorales forment une frontière fragile entre terre et mer. Leur rôle écologique est important : elles réduisent la pollution agricole et sanitaire de l’eau, participent au maintient de l’intégrité des écosystèmes (disponibilité de l’eau, protection contre les inondations, …), et forment un habitat salutaire pour la faune aviaire en migration. Fortement influencées par les activités humaines, les zones humides ont vu leur état se dégrader : leur surface a été réduite de 65%. La gestion qui est désormais mise en œuvre tente de faire le compromis entre exploitation et préservation. C’est l’observation de l’environnement qui oriente les choix de gestion. Un réseau de suivi est alors mis en place sur la qualité des eaux superficielles des marais de Charente-Maritime. Il existe un déficit d’information sur cette question, alors même que plusieurs activités sont directement liées à la "bonne qualité" des eaux (conchyliculture, baignade, …). Au terme de la période 2003-2006, un rapport propose une analyse statistique des données récoltées, à partir de laquelle une typologie des marais est réalisée, discriminant 11 classes de « nature d’eau ».